斑马鱼高通量三维成像研究取得进展
来源:中科院之声 作者: 发布日期:2022-09-17
斑马鱼胚胎具有通体透明特点,适于光学显微镜下的活体观测。光片显微技术(Light-sheet microscopy)是一种新型的三维成像方式,具有光毒性小、扫描速度快等特点。针对斑马鱼、线虫等毫米级模式生物,光片成像需复杂的样品准备流程,且由于视场限制,获得全胚胎的三维数据往往需要多区域成像与拼接,一条受精后3天左右的斑马鱼整个三维成像大约需要15分钟左右,限制了该技术的成像通量。
对此,中国科学院苏州医学工程技术研究所李辉课题组、上海营养与健康研究所潘巍峻课题组合作,提出基于流式光片的高通量显微成像技术LS-FIS(light-sheet flow imaging system)。LS-FIS创新性地将流式成像技术与光片照明技术相结合,通过设计液流与光学耦合系统,结合精密的进取样控制时序与三维重建算法,实现200胚胎/小时的高通量三维成像。
利用该技术,研究人员进行了斑马鱼躯干及头部血管发育研究,统计并分析了受精后3到9天的斑马鱼节间血管三维长度及眼部晶状体血管网形态变化。实验共获得超过500条全胚胎斑马鱼三维图像,这是目前已知首次报道的大规模全鱼三维成像数据。
相关成果发表于 Biomedical Optics Express 。
高通量三维成像系统LS-FIS的原理图和针对上百条斑马鱼3-9天血管发育过程的统计研究
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